Алфавитный перечень упомянутых в проекте топонимов (в основном - разного рода поселений, если не указано иное), сменивших общеупотребительное наименование, новые названия которых удалось установить.
Малая Вяземка (ныне - российское село Малые Вязёмы)
Мариенбург (ныне - польский город Мальборк)
Мариенвердер (ныне - польский город Квидзын)
Марциканцы (ныне - литовское село Марцинконис)
Медники (ныне - литовское село Мядининкай)
Мезотен (ныне - латвийский город Межотне)
Мельзак (ныне - польский город Пенежно)
Меляукен (ныне - российское село Залесье)
Мемель (ныне - литовский город Клайпеда)
Мендзыжец (ныне - польский город Мендзыжец-Подляски)
Меречь (ныне - литовское село Мяркине)
Мильгаузен (ныне - польский город Млынары)
Митава (ныне - латвийский город Елгава)
Могилёв на Днестре (ныне - украинский город Могилёв-Подольский)
Морунген (ныне - польский город Моронг)
Нейгут (ныне - латвийский посёлок Вецумниеки)
Неман, река (ныне в Литве - Нямунас)
Неменчин (ныне - литовский город Неменчине)
Немецкая слобода (ныне - район Лефортово города Москвы)
Немеч (ныне - литовский город Нямежис)
Неммерсдорф (ныне - российское село Маяковское)
Нерунген (ныне - литовский город Няринга)
Новоград (ныне - польский город Новогруд)
Ново-Место (ныне - литовский город Кудиркос-Науместис)
Новые Троки (ныне - литовский город Тракай)
Норденбург (ныне - российское село Крылово)
Обербартау (ныне - латвийское село Барта)
Олай (ныне - латвийский город Олайне)
Олецк (ныне - польский город Олецко)
Олита (ныне - литовский город Алитус)
Олькеники (ныне - литовский город Валкининкай)
Ольшаны (ныне - белорусский город Гольшаны)
Ораны (ныне - литовский город Варена)
Остров (ныне - польский город Острув-Мазовецки)
Паланген (ныне - литовский город Паланга)
Пальшау (ныне - польская деревня Пальчево)
Пассарга, река (ныне в Польше - Пасленка)
Петерхоф (ныне - латвийская деревня Петерниеки)
Пиллау (ныне - российский город Балтийск)
Пильвишки (ныне - литовское село Пильвишкяй)
Пилькаллен (ныне - российский посёлок Добровольск)
Позен (ныне - польский город Познань)
Понары (ныне - литовский посёлок Панеряй)
Понемунь (ныне - район города Каунаса Панемуне)
Попарцы (ныне - литовская деревня Папарцяй)
Поречье (ныне - российский город Демидов)
Потапово (ныне - территория района Южное Бутово города Москвы)
Празниц (ныне - польский город Пшасныш)
Прегель, река (ныне в России - Преголя)
Прель (ныне - латвийский город Прейли)
Прены (ныне - литовский город Пренай)
Прёйсиш-Голланд (ныне - польский город Пасленк)
Прёйсиш-Эйлау (ныне - российский город Багратионовск)
Придруйск (ныне - латвийское село Пиедруя)
Пропойск (ныне - белорусский город Славгород)
Пршелай (ныне - литовское село Пярлоя)
Рагнит (ныне - российский город Неман)
Райгород (ныне - польский город Райгруд)
Раудоники (ныне - литовское село Раудоне)
Рахты (ныне - белорусский город Раков)
Ревель (ныне - эстонский город Таллин)
Ризенбург (ныне - польский город Прабуты)
Романово (ныне - белорусское село Ленино)
Россиены (ныне - литовский город Расейняй)
Румшишки (ныне - литовский город Румшишкес)
Русидань (ныне - латвийский город Пилсрундале)
Рыконты (ныне - литовское село Рыкантай)
Сапежин (ныне - белорусская деревня Сапежинка)
Свенцяны (ныне - литовский город Швянчёнис)
Седлец (ныне - польский город Седльце)
Серпуховская дорога (ныне - Варшавское шоссе из города Москвы)
Скайсгиррен (ныне - российское село Большаково)
Снипишки (ныне - район города Вильнюса Шнипишкес)
Солнышная (ныне - российский город Солнечногорск)
Солоки (ныне - литовский город Салакас)
Старая Калужская дорога (ныне - Калужское шоссе из города Москвы)
Старые Давгелишки (ныне - литовское село Даугелишкис)
Стразбург (ныне - польский город Бродница)
Страстной монастырь (ныне - Пушкинская площадь и Страстной бульвар в городе Москве)
Стрыхов (ныне - польский город Стшыжув)
Таборишки (ныне - литовское село Табаришкес)
Тапиау (ныне - российский город Гвардейск)
Таплакен (ныне - российская деревня Талпаки)
Тауроген (ныне - литовский город Таураге)
Тильзит (ныне - российский город Советск)
Тойт (ныне - российское село Бригадное)
Толпыжин (ныне - украинское село Товпыжин)
Торн (ныне - польский город Торунь)
Тришино (ныне - территория белорусского города Брест)
Троицкое (ныне - российский город Троицк)
Ужогост (ныне - литовское село - Ужугуостис)
Фоминское (ныне - российский город Наро-Фоминск)
Фрауэнбург (ныне - латвийский город Салдус)
Фрауэнбург (ныне - польский город Фромборк)
Фридланд (ныне - российский город Правдинск)
Фридрихштадт (ныне - латвийский город Яунелгава)
Хайлигенбайль (ныне - российский город Мамоново)
Хайнрихсвальде (ныне - российский город Славск)
Цна, река (ныне в Польше - Кшна)
Цоден (ныне - латвийское село Цоде)
Чембар (ныне - российский город Белинский)
Чернова (ныне - белорусское село Чернево)
Шёнеберг (ныне - польское село Осташево)
Шиппенбайль (ныне - польский город Семпополь)
Ширвинты (ныне - литовский город Ширвинтос)
Ширрау (ныне - российское село Дальнее)
Шлок (ныне - район города Юрмала)
Шнайдемюль (ныне - польский город Пила)
Шорзель (ныне - польский город Хожеле)
Шрунден (ныне - латвийский город Скрунда)
Шталлупёнен (ныне - российский город Нестеров)
Штальген (ныне - латвийское село Стальгене)
Эльбинг (ныне - польский город Эльблонг)
Юрбург (ныне - литовский город Юрбаркас)
Якобштадт (ныне - латвийский город Екабпилс)
Янишки (ныне - литовский город Йонишкес)
Янов (ныне - литовский город Йонава)