Новый графический язык в биологии
Хороший рисунок лучше, чем длинная речь (с) Наполеон.
Схемы, часто понятней и удобней, чем описание. К примеру, электрическая схема и в Африке электрическая схема.
А в биологии нет единого стандартного визуального языка. С помощью которого можно описывать сети биохимических взаимодействий, внутри- и межклеточные сигнальные пути. И старение, кстати, тоже. В 2005 году й группой биохимиков и программистов, занимающихся системной биологией, был инициирован проект Грфической Системы Обозначений Системной Биологии - Systems Biology Graphical Notation. Проект финансировался различными организациями Японии, США, ЕЭС и Великобритании. Целью являлось создание стандартизированного языка для графической передачи биологической информации. И совсем недавно, в августе 2009 года результат работы был опубликован в журнале NatureBiotechnologies.
Авторы предлагают 3 ортогональных и комплементарных типа диаграмм - 3 проекции описываемой сложной биологической информации.
1. диаграмма процессов
2. взаимодействие веществ
3. динамика функционирования процесса
Общие символы, представляющие идентичные понятия, минимизируют различия между тремя языками до разницы в синтаксисе и семантике. Вот пример изображения присоединения фосфатной группы к белку (ERK), катализируемого ферментом (MEK) и опосредованного белком-ингибитором (u0126). Слева (а) изображена диаграмма процесса, в центре (b) - схема взаимодействия этих белков, а справа (c) - динамика процесса.
Создание такого языка важно в том числе и для биологии старения.