Глава 6. “Тьмы низких истин нам дороже нас возвышающий обман”
Предисловие https://mary-spiri.livejournal.com/192408.html
Глава 1. https://mary-spiri.livejournal.com/192589.html
Глава 2. https://mary-spiri.livejournal.com/192858.html
Глава 3. https://mary-spiri.livejournal.com/193150.html
Глава 4. https://mary-spiri.livejournal.com/193410.html
Глава 5. https://mary-spiri.livejournal.com/193963.html
Поймать мошенника Фреда за руку нам удалось в последний месяц моей работы в Био-Био. Первый звоночек прозвенел от Золотого Ключика. Тамошние инженеры ломали голову над странным явлением: если есть два образца одинаковой ДНК, из них работает только тот, что побывал в руках у Фреда. Даже если эту ДНК сделали мы, половину послали прямо в ЗК, а вторую послали Фреду на экспертизу, то работает только вторая половина.
Инженеры удивились странностям науки биологии, и решили протестировать оба раствора на "голом" чипе. Ведь растворы эти должны были реагировать, т.е. гибридизироваться с рецептором- ДНКовыми мостиками на чипе. А что если взять "голый" чип без всяких ДНКовых мостиков, где просто нечему будет реагировать с ДНК? Оказалось, что такой чип дает прекрасный положительный сигнал с раствором ДНК от Фреда, и никакого сигнала с нашим образцом. Получается, что ДНКовая гибридизация для сигнала и не нужна, а работает какая-то дополнительная химия, добавленная Фредом. В общем, именно с такого контроля и надо было начинать в самом начале истории с Фредом, но большое начальство не додумалось до простого эксперимента.
Нет пророка в своем отечестве, и все мои слова про то, что Фред мухлюет, не были услышаны, пока Золотой Ключик не получил данные по "голому" чипу. Тогда и мне было позволено заняться расследованием того, что Фред добавляет в растворы ДНК для получения сигнала. Другим фактором оказалось изменение цвета: как известно большинству молекулярных биологов, раствор чистой ДНК в воде - бесцветный и прозрачный. А тут "работающий" раствор ДНК в воде, присланый Фредом, вдруг начал желтеть, причем прямо сразу, как мы его достали из посылки и разморозили.
Желтенький цвет дает один из компонентов магического буфера, пропил галлат (ПГ), который может сам с собою связываться, образуя таннины цвета чая. Если их немного, то как раз и получается желтенький цвет. Начальство спросило изобретателя, в чем растворена его ДНК, и услышав вранье про чистую воду, тут же позволило эксперименты с ПГ. Оказалось, что если его налить в тестовый буфер раз в 20-100 больше, чем в контроле, то получается отличный красивый сигнал, в точности такой, какой дает ДНК Фреда. Мы было обрадовались, что все выяснилось.
Однако наличие лишнего ПГ в образце всегда можно было списать на рассеянность и безалаберность Фреда, мол, с кем не бывает, ливанул лишнего концентрата в буфер, как всегда, очень спешил вам на помощь, молодцы, что нашли и все исправили! А еще ведь есть студенты-лаборанты, на которых можно что угодно свалить, и все поверят. Все знают, какие студенты бывают безалаберные, а у Фреда денег мало, приходится терпеть студентов. Учитывая настроения большого начальства верить миляге-Фреду, злой умысел тут не докажешь, и Фреда не поймаешь.
На какое-то время нам было приказано заниматься своим делом, а именно самим изготавливать ДНКовый рецептор для того, чтобы вешать на электроды. Я разработала методику, ее долго утверждали в верхах, спрашивали всех возможных консультантов, которые хором отвечали, что методика хорошая и работать будет. После чего нам с Жориком повелели воплотить ее в жизнь.
Все это время Фред еженедельно посылал свои растворы ДНК и лично изготовленый рецептор в Золотой Ключик, где делались электронные чипы. Тамошние инженеры вешали рецепторы Фреда на электроды и использовали растворы Фреда как положительный контроль качества чипов, и все шло хорошо, чипы давали сигнал, инженеры получали деньги, и все были при деле. Однако же инженеры никак не могли забыть свои данные про "голый" чип, дающий дивной красоты сигнал. И решили померить, а сколько ДНК им присылает Фред, и совершенно обалдели от несоответствия между реальностью и ожиданием. Мы-то давно привыкли, и образцы Фреда старались для своих экспериментов не использовать, ведь все равно не знаешь, что там налито, он не скажет. А тут Золотой Ключик начал гнать волну и требовать разобраться. Прислали нам растворы Фреда, они их все сохранили, а начальство вдруг засуетилось и потребовало измерений.
Наш Жорик пошел померить концентрацию ДНК и принес несуразные данные. Раньше мы использовали только метод, в котором двуцепочечная ДНК связывается с флуоресцентной краской, он наиболее адекватен, ибо меряет саму спираль ДНК. А тут решили заодно измерить так, как это делает Фред, по поглощению света в ультрафиолете, при длине волны 260 нм. Обычно если ДНК чистая, оба метода неплохо сходятся. А тут ультрафиолет дает концентрацию на 5 порядков больше, чем флуоресцентная метка, у меня глаза на лоб полезли.
Жорик по началу не понял, чего я так возбудилась, я объяснила, что в ультрафиолете поглощает далеко не только ДНК, и такая разница - это как раз тот самый след вещества, которое наш мошенник добавляет для получения сигнала, и след этот вполне материальный и измеряемый. Следующий шаг был мне понятен, и мы рысью побежали к спектрофотометру снимать полные спектры образцов в ультрафиолете. Первым мы сняли спектр пропил галлата, получив два красивеньких пика, в точности, как описано в литературе, 217 и 274 нм. Следующим пошел "положительный" образец от Фреда, кривая спектра пошла вверх, но не там, немножко позже, чем у пропил галлата! След оказался чем-то новеньким, незнакомым, вещество Х, официально не присутствующее во Фредовом буфере. Вот ради таких моментов, когда можно померить, увидеть и понять, - и стоит заниматься точными науками.
Мы срочно продолжили мерить нашу коллекцию образцов. По всем описаниям нашего жулика, каждый образец являет собой очищенную ДНК в воде (тоже чистой!). На самом деле, ДНК в растворах не оказалось вовсе, или было так мало, что не видно на спектре (у нее должен быть пик на 260 нм, а там все было гладко). Зато во всех "положительных" образцах от Фреда вылезал единственный, но огромный пик на длине волны 218 нм. Вещество Х присутствовало в диких количествах, чтобы влезть в шкалу измерения нам пришлось разводить положительные образцы минимум на три порядка (для измерения на чипе их надо разводить всего на один порядок). А в отрицательных образцах ДНК от Фреда это вещество либо полностью отсутствовало, либо его было мало.
Ну вроде бы все ясно и очевидно. Работают только образцы от изобретателя, наша ДНК не работает. А у Фреда только те образцы работают, которые содержат вещество Х. Ну вроде пора гнать изобретателя поганой метлой. Подводя печальный итог, мы доложили наши результаты с красивыми картинками спектров большому боссу Стиву, устроив телеконференцию с Калифорнией. В презентации я очень постаралась обойтись без эмоций - вот факты, интерпретируйте сами.
Первая реакция Стива была: "Фред не мог добавить это вещество нарочно, оно случайно туда само попало. Скорее всего из грязной воды или посуды после мытья, остатки детергентов. ". Я ответила, что речь идет о миллимолярных количествах (минимум квинтиллион молекул на ячейку чипа), это вам не кот чихнул. Более того, если мерить концентрацию ДНК в ультрафиолете, то не заметить это вещество невозможно, оно все забьет, а он спектр якобы снимал, ибо приложил соответствующую распечатку к образцу.
Следующая реакция Стива: "Студенты-лаборанты постарались, а Фред тут ни при чем. А вообще подумай, эту платформу тестировало 8 ученых. Не мог же Фред их всех обмануть?" Тут я глубоко задумалась о критической массе ученых, которую уже нельзя обмануть, и решила, что хотя 8 и магическое число, но магия в науке работать не должна. В момент этой реплики Стива я подняла глаза, и увидела, как моя шефиня Кэти сначала спрятала лицо в ладонях, а потом запустила руки в свои роскошные кудри, и принялась дергать себя за волосы. У каждого свои способы борьбы со стрессом. Впрочем, она промолчала. Я тоже заткнулась, с трудом, призвав совок на помощь. Ведь тебя, Маня, водили к могиле Усатого при приеме в пионеры? И ты промолчала, когда все вокруг ему салютовали? Ведь у тебя всегда были пятерки по научному коммунизму, несмотря на все твое диссидентство? Ну вот и помалкивай, целее будешь. Ибо слишком говорливых на работу не берут, а прослойка - узкая. Всем начальникам нужна лояльность.
Но видимо свои истинные чувства я все же разучилась скрывать, и они стали понятны Стиву. Ибо наутро я получила совершенно роскошное письмо. Вот вольный и сильно сокращенный перевод: "Мария, ты представляешь себе изобретателя Фреда неким дьяволом. Но он не дьявол, если бы он сознательно нас обманывал, у него все образцы бы были положительны, а так - только некоторые. Мне кажется, что Фред - это гениальный ребенок, который резвится на зеленой лужайке, не обращая внимание на законы взрослых. Именно поэтому он постоянно меняет составы своих растворов, условия экспериментов, и нигде не записывает свои игры. А мир взрослых, вся эта твоя молекулярная биология, его конфузит и напрягает, стрессирует бедного мальчика. Так мы никогда с ним не разберемся. Вместо этого нам надо поступить, как делают детские психологи - наблюдать за играющим ребенком. Мне кажется, что нам надо послать кого-нибудь наблюдать за ним в его лаборатории в Монтане, чтобы выяснить, как же он получает свои гениальные результаты.. Но эти уже будет не твоя задача".
Итак - я же и оказалась виновата, что молекулярная биология - точная наука, и что я в ней понимаю. Оконфузила бедное дитя. А между прочим это "гениальное" дитя играло на лужайке в рамках грантов Министерства Обороны на деньги американских налогоплательщиков. Да и компания выбрасывает немалые деньги на игры ребеночка. Впрочем, для меня злой умысел очевиден, и это и есть моя главная проблема - я привыкла быть честной, и отвыкла от политики молчать в тряпочку. Да и зарплату мне платили вполне приличную не за молчание и конформизм, а за мои профессиональные умения, куда несомненно входит и экспертная оценка, т.е. мое мнение.
Глава 1. https://mary-spiri.livejournal.com/192589.html
Глава 2. https://mary-spiri.livejournal.com/192858.html
Глава 3. https://mary-spiri.livejournal.com/193150.html
Глава 4. https://mary-spiri.livejournal.com/193410.html
Глава 5. https://mary-spiri.livejournal.com/193963.html
Поймать мошенника Фреда за руку нам удалось в последний месяц моей работы в Био-Био. Первый звоночек прозвенел от Золотого Ключика. Тамошние инженеры ломали голову над странным явлением: если есть два образца одинаковой ДНК, из них работает только тот, что побывал в руках у Фреда. Даже если эту ДНК сделали мы, половину послали прямо в ЗК, а вторую послали Фреду на экспертизу, то работает только вторая половина.
Инженеры удивились странностям науки биологии, и решили протестировать оба раствора на "голом" чипе. Ведь растворы эти должны были реагировать, т.е. гибридизироваться с рецептором- ДНКовыми мостиками на чипе. А что если взять "голый" чип без всяких ДНКовых мостиков, где просто нечему будет реагировать с ДНК? Оказалось, что такой чип дает прекрасный положительный сигнал с раствором ДНК от Фреда, и никакого сигнала с нашим образцом. Получается, что ДНКовая гибридизация для сигнала и не нужна, а работает какая-то дополнительная химия, добавленная Фредом. В общем, именно с такого контроля и надо было начинать в самом начале истории с Фредом, но большое начальство не додумалось до простого эксперимента.
Нет пророка в своем отечестве, и все мои слова про то, что Фред мухлюет, не были услышаны, пока Золотой Ключик не получил данные по "голому" чипу. Тогда и мне было позволено заняться расследованием того, что Фред добавляет в растворы ДНК для получения сигнала. Другим фактором оказалось изменение цвета: как известно большинству молекулярных биологов, раствор чистой ДНК в воде - бесцветный и прозрачный. А тут "работающий" раствор ДНК в воде, присланый Фредом, вдруг начал желтеть, причем прямо сразу, как мы его достали из посылки и разморозили.
Желтенький цвет дает один из компонентов магического буфера, пропил галлат (ПГ), который может сам с собою связываться, образуя таннины цвета чая. Если их немного, то как раз и получается желтенький цвет. Начальство спросило изобретателя, в чем растворена его ДНК, и услышав вранье про чистую воду, тут же позволило эксперименты с ПГ. Оказалось, что если его налить в тестовый буфер раз в 20-100 больше, чем в контроле, то получается отличный красивый сигнал, в точности такой, какой дает ДНК Фреда. Мы было обрадовались, что все выяснилось.
Однако наличие лишнего ПГ в образце всегда можно было списать на рассеянность и безалаберность Фреда, мол, с кем не бывает, ливанул лишнего концентрата в буфер, как всегда, очень спешил вам на помощь, молодцы, что нашли и все исправили! А еще ведь есть студенты-лаборанты, на которых можно что угодно свалить, и все поверят. Все знают, какие студенты бывают безалаберные, а у Фреда денег мало, приходится терпеть студентов. Учитывая настроения большого начальства верить миляге-Фреду, злой умысел тут не докажешь, и Фреда не поймаешь.
На какое-то время нам было приказано заниматься своим делом, а именно самим изготавливать ДНКовый рецептор для того, чтобы вешать на электроды. Я разработала методику, ее долго утверждали в верхах, спрашивали всех возможных консультантов, которые хором отвечали, что методика хорошая и работать будет. После чего нам с Жориком повелели воплотить ее в жизнь.
Все это время Фред еженедельно посылал свои растворы ДНК и лично изготовленый рецептор в Золотой Ключик, где делались электронные чипы. Тамошние инженеры вешали рецепторы Фреда на электроды и использовали растворы Фреда как положительный контроль качества чипов, и все шло хорошо, чипы давали сигнал, инженеры получали деньги, и все были при деле. Однако же инженеры никак не могли забыть свои данные про "голый" чип, дающий дивной красоты сигнал. И решили померить, а сколько ДНК им присылает Фред, и совершенно обалдели от несоответствия между реальностью и ожиданием. Мы-то давно привыкли, и образцы Фреда старались для своих экспериментов не использовать, ведь все равно не знаешь, что там налито, он не скажет. А тут Золотой Ключик начал гнать волну и требовать разобраться. Прислали нам растворы Фреда, они их все сохранили, а начальство вдруг засуетилось и потребовало измерений.
Наш Жорик пошел померить концентрацию ДНК и принес несуразные данные. Раньше мы использовали только метод, в котором двуцепочечная ДНК связывается с флуоресцентной краской, он наиболее адекватен, ибо меряет саму спираль ДНК. А тут решили заодно измерить так, как это делает Фред, по поглощению света в ультрафиолете, при длине волны 260 нм. Обычно если ДНК чистая, оба метода неплохо сходятся. А тут ультрафиолет дает концентрацию на 5 порядков больше, чем флуоресцентная метка, у меня глаза на лоб полезли.
Жорик по началу не понял, чего я так возбудилась, я объяснила, что в ультрафиолете поглощает далеко не только ДНК, и такая разница - это как раз тот самый след вещества, которое наш мошенник добавляет для получения сигнала, и след этот вполне материальный и измеряемый. Следующий шаг был мне понятен, и мы рысью побежали к спектрофотометру снимать полные спектры образцов в ультрафиолете. Первым мы сняли спектр пропил галлата, получив два красивеньких пика, в точности, как описано в литературе, 217 и 274 нм. Следующим пошел "положительный" образец от Фреда, кривая спектра пошла вверх, но не там, немножко позже, чем у пропил галлата! След оказался чем-то новеньким, незнакомым, вещество Х, официально не присутствующее во Фредовом буфере. Вот ради таких моментов, когда можно померить, увидеть и понять, - и стоит заниматься точными науками.
Мы срочно продолжили мерить нашу коллекцию образцов. По всем описаниям нашего жулика, каждый образец являет собой очищенную ДНК в воде (тоже чистой!). На самом деле, ДНК в растворах не оказалось вовсе, или было так мало, что не видно на спектре (у нее должен быть пик на 260 нм, а там все было гладко). Зато во всех "положительных" образцах от Фреда вылезал единственный, но огромный пик на длине волны 218 нм. Вещество Х присутствовало в диких количествах, чтобы влезть в шкалу измерения нам пришлось разводить положительные образцы минимум на три порядка (для измерения на чипе их надо разводить всего на один порядок). А в отрицательных образцах ДНК от Фреда это вещество либо полностью отсутствовало, либо его было мало.
Ну вроде бы все ясно и очевидно. Работают только образцы от изобретателя, наша ДНК не работает. А у Фреда только те образцы работают, которые содержат вещество Х. Ну вроде пора гнать изобретателя поганой метлой. Подводя печальный итог, мы доложили наши результаты с красивыми картинками спектров большому боссу Стиву, устроив телеконференцию с Калифорнией. В презентации я очень постаралась обойтись без эмоций - вот факты, интерпретируйте сами.
Первая реакция Стива была: "Фред не мог добавить это вещество нарочно, оно случайно туда само попало. Скорее всего из грязной воды или посуды после мытья, остатки детергентов. ". Я ответила, что речь идет о миллимолярных количествах (минимум квинтиллион молекул на ячейку чипа), это вам не кот чихнул. Более того, если мерить концентрацию ДНК в ультрафиолете, то не заметить это вещество невозможно, оно все забьет, а он спектр якобы снимал, ибо приложил соответствующую распечатку к образцу.
Следующая реакция Стива: "Студенты-лаборанты постарались, а Фред тут ни при чем. А вообще подумай, эту платформу тестировало 8 ученых. Не мог же Фред их всех обмануть?" Тут я глубоко задумалась о критической массе ученых, которую уже нельзя обмануть, и решила, что хотя 8 и магическое число, но магия в науке работать не должна. В момент этой реплики Стива я подняла глаза, и увидела, как моя шефиня Кэти сначала спрятала лицо в ладонях, а потом запустила руки в свои роскошные кудри, и принялась дергать себя за волосы. У каждого свои способы борьбы со стрессом. Впрочем, она промолчала. Я тоже заткнулась, с трудом, призвав совок на помощь. Ведь тебя, Маня, водили к могиле Усатого при приеме в пионеры? И ты промолчала, когда все вокруг ему салютовали? Ведь у тебя всегда были пятерки по научному коммунизму, несмотря на все твое диссидентство? Ну вот и помалкивай, целее будешь. Ибо слишком говорливых на работу не берут, а прослойка - узкая. Всем начальникам нужна лояльность.
Но видимо свои истинные чувства я все же разучилась скрывать, и они стали понятны Стиву. Ибо наутро я получила совершенно роскошное письмо. Вот вольный и сильно сокращенный перевод: "Мария, ты представляешь себе изобретателя Фреда неким дьяволом. Но он не дьявол, если бы он сознательно нас обманывал, у него все образцы бы были положительны, а так - только некоторые. Мне кажется, что Фред - это гениальный ребенок, который резвится на зеленой лужайке, не обращая внимание на законы взрослых. Именно поэтому он постоянно меняет составы своих растворов, условия экспериментов, и нигде не записывает свои игры. А мир взрослых, вся эта твоя молекулярная биология, его конфузит и напрягает, стрессирует бедного мальчика. Так мы никогда с ним не разберемся. Вместо этого нам надо поступить, как делают детские психологи - наблюдать за играющим ребенком. Мне кажется, что нам надо послать кого-нибудь наблюдать за ним в его лаборатории в Монтане, чтобы выяснить, как же он получает свои гениальные результаты.. Но эти уже будет не твоя задача".
Итак - я же и оказалась виновата, что молекулярная биология - точная наука, и что я в ней понимаю. Оконфузила бедное дитя. А между прочим это "гениальное" дитя играло на лужайке в рамках грантов Министерства Обороны на деньги американских налогоплательщиков. Да и компания выбрасывает немалые деньги на игры ребеночка. Впрочем, для меня злой умысел очевиден, и это и есть моя главная проблема - я привыкла быть честной, и отвыкла от политики молчать в тряпочку. Да и зарплату мне платили вполне приличную не за молчание и конформизм, а за мои профессиональные умения, куда несомненно входит и экспертная оценка, т.е. мое мнение.