(Untitled)

Feb 06, 2009 17:18

Этот пост рассказывает о продолжении научного проекта, целью которого является моделирование нервной системы нематоды C. Elegans, включая сенсорные клетки, подающие сигнал в "мозг" и мышцы, которые "мозгом" управляются ( Read more... )

my projects, neuroscience, c. elegans

Leave a comment

Comments 23

walter_simons February 6 2009, 11:51:38 UTC
Офигительная новость! Нужна ли помощь процессорным временем?

Reply

mozgoved_neo February 6 2009, 13:05:43 UTC
Спасибо, но к счастью персоналка (Core2Duo 3ГГц) пока справляется в реал-тайме, включая физику, графику и динамику нейросети. Помощь нужна на уровне обработки данных о связях между нейронами (выявление закономерностей с учетом частично неполных/ частично ошибочных данных) вручную по отдельным логическим контурам, поскольку даже для такого "простого" организма оказалось невозможным охватить в виде единого образа взаимодействия между 300 нейронами, связанными более чем 5000 связями. Хотя вначале мне казалось, что 300 - это практически ничто, и C. Elegans слишком прост, чтобы представлять серьезный интерес, и только поэтому такой модели до сих пор нет. Однако, дело обстоит совсем иначе - усилия десятков серьезных лабораторий в последнее время оказались направлены именно на эту задачу, но финал пока не виден, полноценная действующая модель пока так и не создана. Так-то :)

Reply

side_effect February 9 2009, 07:25:09 UTC
Помощь нужна на уровне обработки данных о связях между нейронами (выявление закономерностей с учетом частично неполных/ частично ошибочных данных) вручную по отдельным логическим контурам

а какого рода закономерности нужно выявлять и для чего?

Reply

mozgoved_neo February 9 2009, 10:50:27 UTC
Есть 3D-координаты нейронов в теле C. Elegans, можно вычислить координаты каждой мышцы. Есть информация о связях между нейронами и нейронами, мышцами и нейронами, сенсорами и нейронами. Связи в основном направленные, за исключением electric junctions между нейронами. Есть также активирующие/ингибирующие. Если соединить все контактирующие пары в 3D линиями, получится хаос (пробовал) :) Однако, по крайней мере вентральный корд (линейная, проходящая вдоль тела, последовательность из ~50 мотонейронов, отвечающая за управление мышцами тела, по логике должна быть периодической или иметь какие-то закономерности, иначе движения, которые мы наблюдаем у живого червя, практически наверняка были бы невозможны. Некоторых связей не хватает (еще экспериментально не определены), некоторые, возможно, лишние. Весов, приписываемых связям, нет, но возможно удастся вычислить геометрические характеристики (длина, диаметр) с микрофотографий. Поэтому каждый контур придется перебирать вручную, с целью представить его наглядно и _понять_, как он работает, и ( ... )

Reply


annasam February 6 2009, 13:22:19 UTC
"Гнутый двухсторонний карандаш" выглядит очень эффектно!

Моё мнение, что при такой интересной теме не стоит ограничиваться подачей заявок только в РФФИ. А во всяких конкурсах опубликованность данных является большим плюсом. Так что если материала на полноценную статью хватает, я бы написала сейчас. И пока идёт небыстрый процесс публикации двигалась бы дальше, попутно подавая заявки во всевозможные фонды (ведь для того, чтобы создать себе имя очень желательно примелькаться на серьезных конференциях, обрастая связями, а для этого нужны средства), указывая в планах то, что уже частично сделано после написания статьи.
Кстати, недавно видела имя твоего отца в списке самых цитируемых учёных России. Желаю повторить и приумножить :)

Reply

mozgoved_neo February 6 2009, 13:32:28 UTC
Да, пожалуй, стоит уже писать, материал есть. Да и насчет остального ты тоже совершенно права, спасибо за советы!
А где можно этот список самых цитируемых ученых увидеть?

Reply

annasam February 6 2009, 14:09:32 UTC
http://www.scientific.ru/whoiswho/active7.html

И с получением диплома!

Reply


(The comment has been removed)

mozgoved_neo February 6 2009, 17:11:24 UTC
Спасибо!
Я в самом начале этой деятельности хотел заниматься именно AI, года два просто читал статьи и книги про строение и работу человеческого мозга, память, сознание, нейроны (которые, вопреки тому, что рассказывали в детстве, еще как восстанавливаются, а также могут образовывать новые связи, заменять друг друга и т.д.) Потом были первые попытки строить искусственные нейросети для распознавания образов и синтеза речи, а еще в том же своем физическом симуляторе была собрана модель робота, у которого есть управляемые мышцы (но пока совершенно нет мозга - управление с клавиатуры). Успехи были весьма скромны, хотя усилий вложено изрядно. Но зато я понял, насколько это действительно сложно, что мне, чтобы действительно разобраться, как это работает, необходим объект попроще, а вот если и когда его осилим, там дальше поглядим.

Reply


bonesdmz February 6 2009, 18:08:48 UTC
Круто! :)

Reply


neon_fit February 8 2009, 03:36:24 UTC
Дух захватывает!

Reply


Leave a comment

Up