Основы.

Aug 01, 2010 14:43


Другие записи: асски отжик | ДЫРОЧКА!!! + сумбурный пост на скорую руку....... | Adobe Illustrator CS3 Test 1 - Gir by 335 (original design - Jhonen Vasquez) | Лыжник-нудист

Упрощенное, с целью облегчения восприятия и избавления от не нужных деталей, изложение основ...

ДНК человека это "лента" составленная из кусочков разного материала, есть техники позволяющие определить наличие в этой "ленте" повторяющихся участков.

Допустим имеется 100 видов таких участков. (На одной из самых больших online баз данных ДНК ySearch.org [65000 результатов днк тестов] именно 100 видов таких участков). Участки далее будут называться "маркерами".

Итак после проведения анализа код человека можно записать следующим образом:

маркер_1:кол-во повторений маркер_1
маркер_2:кол-во повторений маркер_2
...
маркер_100:кол-во повторений маркер_100

т.е. получаем 100 значений кол-в повторений маркеров (американская фирма FamilyTreeDNA предлагает тесты определяющие кол-во повторений 12, 37 и 67 маркеров.).

Иногда, для простоты изложения, маркеры сортируют, названия опускают и просто пишут кол-во повторений : 11-12-14 и т.д.

У отца и сына кол-во повторений маркеров полностью совпадают за исключением случаев "мутаций".
Мутация - это когда уменьшается или увеличивается кол-во повторений одного или группы маркеров.
У каждого маркера мутация предсказуема т.е. к примеру
маркер_1 мутирует на 100 передач от отца к сыну
маркер_2 мутирует на 200 передач от отца к сыну
и т.д.

Для того чтобы определить сколько максимально поколений назад был общий отец у двух людей достаточно разделить разницу между кол-вами повторений в одинаковых маркерах на скорость мутаций соответствующего маркера.

Скорость мутации определена с некоторой вероятностью поэтому результат операции будет достоверен настолько же насколько достоверно определение скорости мутации маркера. ( если мутировали несколько маркеров вероятности необходимо перемножать... кол-во повторение маркеров также определены с некоторой достоверностью... ) .

Обычно проводят тестирование на 12, 37 или 67 маркеров.

Результаты тестирования можно записать в таком виде :

DYS 19 - 16
DYS 389I - 14
DYS 389II - 31
DYS 390 - 23
DYS 391 - 10
DYS 392 - 12
DYS 393 - 15
DYS 385 ab - 15, 15
DYS 437 - 14
DYS 438 - 10
DYS 439 - 11
DYS 448 - 20
DYS 456 - 16
DYS 458 - 15
DYS 635 - 21
GATA H4 - 11

или просто последовательность 16-14-31-...

Соответственно если "расстояние" полученного набора не далеко от базового для какой либо из гаплогрупп, то этого человека следует отнести к соответствующей гаплогруппе.

------------
Онлайн базы данных ( везде разные системы "маркеров" )
http://www.yhrd.org/Analyse
http://www.appliedbiosystems.com/yfilerdatabase/
http://www.ysearch.org/add_start.asp?uid=
http://www.smgf.org/ychromosome/search.jspx - один из самых удобных сайтов

маркеров, насколько, базового, изложение, составленная

Previous post Next post
Up